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三種腦炎的腦脊液鑒別，在臨床上最常見的三種腦炎是化膿性腦膜炎、結(jié)核性腦膜炎和病毒性腦膜炎。這三種腦炎的鑒別，主要分為壓力、蛋白質(zhì)、葡萄糖和氯化物。在壓力和蛋白質(zhì)方面，這三種腦炎都升高，但是升高的最明顯的是化膿性腦膜炎，接著是結(jié)核性腦膜炎，然后是病毒性腦膜炎。

在葡萄糖和氯化物方面，化膿性腦膜炎和結(jié)核性腦膜炎都下降，而病毒性腦膜炎基本上是在正常范圍之內(nèi)。在白細(xì)胞計(jì)數(shù)方面，化膿性腦膜炎顯著增高，且多為中性粒細(xì)胞，而結(jié)核性腦膜炎也是顯著升高，但是多為淋巴細(xì)胞，病毒性腦炎也是多為淋巴細(xì)胞。