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引起生殖器皰疹的病毒主要有單純皰疹病毒Ⅰ型和單純皰疹病毒Ⅱ型，單純皰疹病毒Ⅰ型是口唇部皰疹的主要病因，口交行為是生殖器皰疹的常見誘因之一。

在肛門生殖器皰疹中，單純皰疹病毒Ⅰ型的感染力比之前升高，在男男同性戀及女女同性戀中發(fā)現(xiàn)的比較多。單純皰疹病毒Ⅱ型是生殖器皰疹發(fā)作最常見和最主要的原因，是亞臨床癥狀及無癥狀排毒期間間歇性排毒的主要病因。目前生殖器皰疹Ⅰ型和Ⅱ型均可誘發(fā)患者病情反復發(fā)作，但病情復發(fā)在Ⅱ型皰疹病毒中更為常見，皰疹病毒的分型有利于患者病情評估和預后估測。

目前對皰疹病毒的檢測有兩種手段，一種是病毒學檢測，即對皮病損處的組織和細胞進行培養(yǎng)，但是因為檢測率靈敏度較低，臨床上多采用聚合酶鏈式反應即PCR反應，生殖器皰疹為間歇性排毒，所以PCR檢測結(jié)果陰性并不能排除沒有皰疹病毒的感染。血清學檢測是血清學皰疹病毒抗體檢測，主要用于臨床上無癥狀的HSV感染的監(jiān)測。