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一般來說第二代試管嬰兒與第一代試管嬰兒的操作方法相同，主要分為三步，即取卵和取精子、合成受精卵、移植胚胎。二代試管嬰兒主要適用于畸形精子癥、不可逆的梗阻性無精子癥等患者。
1、取卵和取精子：一般會給女性使用促排卵的藥物，以獲得促進卵子成熟，然后在B超引導下獲得成熟卵子，男性一般是通過自慰、手術等方式來獲取精子。
2、合成受精卵：專業(yè)人員會在顯微操作系統(tǒng)下選擇形態(tài)較好的精子，然后將精子注射到卵細胞的胞漿內形成受精卵，并進行培養(yǎng)。
3、移植胚胎：將受精卵培養(yǎng)到適宜移植的時候，則會移植入母體的子宮內，但具體移植的數目，需要根據患者意愿，以及具體的身體情況進行判斷。
一般來說完成第二代試管嬰兒操作后，通常不會對患者的正常生活和工作造成影響，但建議女性在1-2月內，避免進行重體力勞動，盡量多休息，并遵醫(yī)囑到醫(yī)院婦產科就診，進行血清HCG、腹部B超等檢查，以明確是否懷孕。