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造血干細(xì)胞移植的原理，即把受者的造血干細(xì)胞清除，然后用供者的造血干細(xì)胞替換受者的造血干細(xì)胞。臨床上主要是三大器官產(chǎn)生排異，具體如下：

1、腸道排異：表現(xiàn)為腹瀉，而腹瀉的嚴(yán)重程度不同。如嚴(yán)重腹瀉時，可能排出腸黏膜，此時為嚴(yán)重排異；

2、皮膚排異：輕者表現(xiàn)為皮疹，重者可以表現(xiàn)為皮膚剝脫、皮膚嚴(yán)重炎癥反應(yīng)；

3、肝臟排異：主要造成膽管損傷導(dǎo)致黃疸形成。除黃疸外，還可以從化驗指標(biāo)上反映出膽汁淤積。

由于造血系統(tǒng)和免疫系統(tǒng)共用同一個系統(tǒng)，因此供者的造血干細(xì)胞植入到受者體內(nèi)后，在受者體內(nèi)重建造血功能的同時，也在重建免疫功能。由于機(jī)體主要依靠淋巴系統(tǒng)行使免疫功能，因此重建的免疫功能主要指淋巴細(xì)胞。造血細(xì)胞和免疫細(xì)胞來源于供者，而身體的其它器官是受者原來的器官，因而進(jìn)入受者體內(nèi)的免疫細(xì)胞，會與原來的器官發(fā)生沖突，其本質(zhì)是供者的細(xì)胞排斥受者的細(xì)胞和組織。