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兒童的矮小癥分類比較復(fù)雜，有的可以根據(jù)外觀勻稱和不勻稱來分類，也可以根據(jù)生長激素缺乏和不缺乏來分類。
常見的矮小原因有宮內(nèi)發(fā)育遲緩，包括雙胎，還有兒童生長激素缺乏性矮小、甲狀腺功能低下性矮小、皮質(zhì)醇增多癥、家族性矮小、特發(fā)性矮小，也就是生長激素不缺乏性矮小，但由于生長激素的生物活性不足也會造成矮小。
青春發(fā)育延遲矮小、遺傳代謝疾病、維生素D缺乏矮小、骨骼發(fā)育導(dǎo)致矮小，比如軟骨發(fā)育不良性矮小，還有心因性矮小，比如心理出現(xiàn)障礙而影響生長發(fā)育等，比較復(fù)雜。
還有特殊類型的遺傳代謝性疾病，其非常專業(yè)，不再贅述。